1月：
1月14日，首屆華潤三九研發工作會議在深圳總部召開。本次會議的主題是“在公司大運營中心的戰略指導下，整合研發資源、形成 “大研發”概念，即統一研發方向、統一立項流程；進而逐步形成統一的研發體系”；介紹華潤三九的研發戰略、管理架構，傳導總部“運營中心”的研發管理思路；回顧總結兩年來圍繞戰略主題的研發工作,并就2010年研發工作做出具體部署。
1月，根據華潤集團管理模式發展的新定位，華潤三九被確定為華潤集團重點投入、重點發展的7個戰略業務單元（簡稱SBU）之一，進入華潤集團“一級利潤中心”序列。

2月：
2月11日，公司名稱正式由"三九醫藥股份有限公司"變更為"華潤三九醫藥股份有限公司"；英文名稱由"Sanjiu Medical & Pharmaceutical Co., Ltd."變更為"China Resources Sanjiu Medical & Pharmaceutical Co., Ltd."。2月24日，公司證券簡稱由"三九醫藥"變更為"華潤三九"；英文簡稱變更為"CR Sanjiu"。公司股票代碼"000999"不變。

3月：
3月，“參附注射液質量控制及治療厥脫的臨床與實驗研究”，獲中華中醫藥學會科學技術獎，該項研究由雅安三九藥業和北京中醫藥大學聯合主持并推進。雅安三九藥業“參附注射液”為全國首創，獨家生產。

4月：
4月中旬，華潤三九被認定為“國家高新技術企業”。華潤三九醫藥股份有限公司近日喜獲國家級高新技術企業認定。這是繼2007年度公司獲評“深圳市高新技術企業”以來，獲得的又一項重要殊榮。“國家高新技術企業”的正式獲批，充分肯定了華潤三九的研發水平與創新能力，高度展現了華潤三九的綜合實力，將進一步推動華潤三九的自主創新與科技成果轉化進程。
４月１４日，青海玉樹地區發生里氏７.１級地震，華潤三九迅速決定通過下屬的雅安三九藥業，捐贈一批災區急需的藥品999參附注射液、999強力枇杷露，價值52.6萬元。公司廣大員工積極為抗震救災捐款，5月7日，華潤三九將公司員工為災區人民捐助的愛心款共298333.3元匯至華潤慈善基金。

7月：
7月上旬，華潤三九實施了首期風險評估流程，通過風險評估識別出公司前十大重大風險，并對其剩余風險水平進行評估。十大重大風險分別涉及運營、市場和戰略等領域。針對十大風險公司確定了應對策略及解決方案。董事會秘書處和審計部將持續監督上述重大風險的改進情況。

8月：8月6日，“ ”商標正式在國家工商總局商標局成功注冊，注冊號為4777496。自此，華潤三九在第5類的“人用藥、醫藥制劑、中藥成藥、生化藥品、凈化劑、外科用織物”等商品類別中使用“ ”商標，受到法律保護，享有專用權。

9月：
9月13至14日，華潤三九2010年生產系統工作者年會在湖南郴州召開。本次年會以“新起點、新目標、新追求”為主題，突出“聚焦戰略、注重過程、提升能力”，圍繞公司未來戰略目標生產運營的全過程改善，以及供應鏈運作、成本控制和技術創新三個能力的提升，開展“質量管理”、“供應鏈管理”、“精益生產”等經驗交流。

10月：
10月21日，北京市藥品監督管理局下發通知，華潤三九及各下屬生產企業與北京醫藥股份有限公司共同向北京市藥品監督管理局申請的三方物流委托業務，已經批復同意。至此，華潤三九在北京地區設立物流中心得到藥品監管部門的正式認可，結束了公司多年來無法在廣東省外設立倉庫的局面。
10月下旬，參附注射液喜獲第十二屆“中國專利優秀獎”。“中國專利獎”由國家知識產權局設立，是國內專利評比上的最高獎項之一。

12月：
12月1日，華潤三九“產品身份管理”項目簽約儀式在華潤三九醫藥工業園舉行。該項目正式啟動，將在2011年3月31日前完成建設和驗收。